Vládny rámec na eurofondy, na základe ktorého by v rokoch 2007 až 2013 mohlo z rozpočtu únie prísť na Slovensko vyše 400 miliárd korún, má jedenásť operačných programov. Minister Janušek očakáva, že komisia návrh odsúhlasí. Pripúšťa však, že by mohla mať k dokumentu určité návrhy a pripomienky. „Pripomienky komisie samozrejme do návrhu zapracujeme,“ povedal Janušek.
Prvé výzvy na projekty z operačných programov by sa mohli podľa ministra objaviť v apríli alebo máji budúceho roka. Na základe doterajších skúseností sa ministerstvo snaží zjednodušiť celý proces posudzovania žiadostí, aby sa umožnilo čo najvyššie percento čerpania. Nový balík peňazí z európskych fondov pre Slovensko bude pritom v prepočte na jeden rok až trikrát vyšší oproti tomu, čo Slovensko získalo v rokoch 2004 až 2006. To si vyžiada aj dodatočné administratívne kapacity, ktoré by sa mali vyhodnocovaniu predkladaných projektov venovať. Podľa Januška to môže znamenať ďalších 500 ľudí navyše, ktorí by však mali byť platení z európskych zdrojov a štátnu kasu by tak nezaťažovali.
Cieľom využitia eurofondov by malo byť výrazné zvýšenie konkurencieschopnosti a výkonnosti regiónov a slovenskej ekonomiky a zamestnanosti pri rešpektovaní trvalo udržateľného rozvoja. Najväčší dôraz by sa mal klásť na infraštruktúru, ľudské zdroje a znalostnú ekonomiku. Najviac peňazí by z eurofondov malo ísť na dopravu, a to približne 3,2 miliardy eur, čo je v prepočte vyše 110 miliárd korún. Za dopravou nasleduje podpora životného prostredia a regionálny operačný program.